Die Banerji-Protokolle fußen ganz grundsätzlich auf der Erkenntnis, dass die Arbeit mit homöopathischen Mitteln keine "Schwingungsmedizin" ist, sondern eine Therapie mit Medikamenten -feinste Materie (Nanopartikel)- nachvollziehbarer Wirkung.
Zuerst allerdings war es die jahrzehntelange praktische Erfahrung dieser traditionsreichen Familie Banerji, welche homöopathische Arzneimittel konkret auf Krankheitsbilder bezogen einsetzte -aus einer riesigen praktischen Erfahrung heraus-. Die wissenschaftliche Erkenntnis einer "Nanomedizin" kam später -siehe hierzu "Nanodynamik" von Dr. E. S. Rajendran-.
Einsetzbar ist diese Methode bei sehr vielen Erkrankungen.
Zusätzlich erfährt diese Therapieform eine Individualisierung durch die Erkenntnisse der Paracelsusmedizin -Geburtsherrscheranalyse- im Rahmen des Heptopathiekonzeptes von Frau Dr. Michaela Dane und Herrn Dr. Miguel Corty Friedrich.